Цитирование проекта OnSiteSeq

📕 Статья в индексе РИНЦ — методология BioMLOps

Горбенко Р. А. «Методология управления жизненным циклом машинно-обучаемых моделей в биомедицинских приложениях: исследование на данных о резистентности ВИЧ‑1» // Молодёжь и современные информационные технологии: сборник трудов XXIII Международной научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых учёных (Томск, 18–20 февраля 2026 г.). — Томск: Национальный исследовательский Томский политехнический университет, 2026. — С. 370–375.

✅ Работа входит в индекс РИНЦ (eLIBRARY ID: 91848892, EDN: WETXLG).

В этой статье описан подход BioMLOps — адаптация методологий MLOps для задач вычислительной биологии. Подход обеспечивает управляемый жизненный цикл моделей: от выбора архитектуры (CNN + Self-Attention) до непрерывного мониторинга метрик на эталонных данных, автоматическое версионирование экспериментов с регрессионным тестированием и пайплайн дообучения при обновлении внешних баз (Stanford HIVDB) с автоматической детекцией деградации качества модели. Эффективность показана на системе HIV‑1‑Resist‑Rus; код и веса моделей открыты на GitVerse.

🔗 https://www.elibrary.ru/item.asp?id=91848892

Метод HIV-1-M-Env-Rus опубликован в материалах 64‑й Международной научной студенческой конференции (МНСК‑2026), НГУ, 2026, с. 155.

🔗 https://www.nsu.ru/n/issc/collection/

Горбенко Р. А. «Определение резистентности и классификация субтипов ВИЧ‑1 на ПАК OnSiteSeq» // 68‑я Всероссийская научная конференция МФТИ (секция «Биологическая и медицинская физика»), 2026.

🔗 https://conf.mipt.ru/page/conference-materials

🏛 Философия инженерной деятельности — terra nullius медицины будущего

Горбенко Р. А. «Автономные диагностические системы с искусственным интеллектом как terra nullius медицины ближайшего будущего» // Свет и тени цифровой реальности: живой интеллект и его аватары: тезисы IV Всероссийской конференции с международным участием (Пермь, ПГНИУ, 26–27 марта 2026 г.). — Пермь: Пермский государственный национальный исследовательский университет, 2026. — С. 162–166.

Работа вышла в секции «Философия инженерной деятельности: terra nullius инженеров и гуманитариев». В ней опыт создания линейки OnSiteSeq осмыслен философски: автономная диагностическая система с ИИ — это не просто инструмент, а субъект принятия витальных решений, что порождает «моральную зону деформации» (Moral Crumple Zone, М. Элиш) и вопрос распределения ответственности за ошибку — между разработчиком базовой модели, Medtech-интегратором и врачом. Технологический ответ на кадровый кризис и «медицинские пустыни» отдалённых регионов ставит философские вопросы, на которые у медицины пока нет готовых ответов.

Статья на Хабре: «Как мы разработали ML-модели для определения лекарственной устойчивости и субтипа ВИЧ-1»

🔗 https://habr.com/ru/companies/mipt_digital/articles/1058460/