Классификация причины ОРВИ (поиск вирусных возбудителей)

Roman Gorbenko / January 2025 (196 Words, 2 Minutes)

ОРВИ

Суть: Мобильная платформа для сверхбыстрого обнаружения, идентификации и количественного анализа полного спектра вирусных возбудителей ОРВИ в метагеномном образце (мазок из носоглотки/ротоглотки). Забор и анализ выполняются непосредственно у кровати пациента (клиника, дом, приемный покой).

Проблема, которую решает OnSiteSeq

“Слепая” терапия:
- Лечение ОРВИ преимущественно симптоматическое из-за отсутствия оперативной информации о возбудителе.
- Следствия:
  - Необоснованное назначение антибиотиков: Главный драйвер глобальной антибиотикорезистентности.
  - Упущенное окно для этиотропной терапии: Противовирусные (напр., против гриппа) эффективны только в первые 48 часов.
Запоздалая и неполная диагностика:
- Стандартные лабораторные ПЦР-тесты занимают часы-сутки.
- Экспресс-тесты ограничены 2-3 патогенами (Грипп A/B, COVID-19), игнорируя десятки других (РСВ, риновирус, аденовирус и др.).
Риск внутрибольничных вспышек:
- Запоздалая идентификация высококонтагиозных вирусов (РСВ в педиатрии, грипп в гериатрии) может привести к неконтролируемым нозокомиальным вспышкам.
Сложность дифференциальной диагностики:
- Симптомы ОРВИ схожи, но прогноз и тактика ведения различаются (напр., РСВ у младенцев требует особого внимания).

Планируемый сценарий использования OnSiteSeq

Простой забор пробы:
- Врач/медсестра берет стандартный мазок из носоглотки/ротоглотки.
Быстрая пробоподготовка (на месте):
- Использование одноразовых картриджей OnSiteSeq.
- Максимальная автоматизация выделения суммарной РНК/ДНК.
- Не требует спец. навыков, занимает минуты.
Нано-поровое секвенирование (на месте):
- Аппаратная часть немедленно начинает секвенирование.
- Ключевые преимущества технологии:
  - Прямое секвенирование РНК: Обнаружение РНК-вирусов (грипп, коронавирусы, РСВ и др.) без этапа обратной транскрипции → скорость ↑, точность ↑.
  - Длинные риды: Безошибочная идентификация вируса и определение штамма/варианта.
  - Анализ в реальном времени: Данные генерируются и обрабатываются потоком.
AI-Анализ в реальном времени (на месте):
- Идентификация: ИИ, обученный на тысячах вирусных геномов, мгновенно сканирует поток данных, выявляя все клинически значимые респираторные вирусы:
  - Грипп A/B, SARS-CoV-2, РСВ (респираторно-синцитиальный вирус)
  - Риновирусы, аденовирусы, метапневмовирусы, вирусы парагриппа
  - Сезонные коронавирусы (HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1) и др.
- Дифференциация штаммов: Точное определение варианта SARS-CoV-2 (Омикрон и др.), субтипа гриппа (H1N1, H3N2), выявление маркеров устойчивости к противовирусным препаратам (напр., к осельтамивиру).
- Обнаружение коинфекций: Метагеномный подход выявляет наличие нескольких вирусных возбудителей одновременно.
Интуитивный отчет (на месте):
- Через 20-60 минут врач получает отчет на экране устройства/планшета:
  - Обнаруженные патогены: Список с указанием вирусной нагрузки.
  - Клиническая значимость: Информация о штамме/варианте.
  - Рекомендации: Уведомление о маркерах резистентности к препаратам, рекомендации по таргетной терапии и изоляции пациента.